CHLOROPLAST EVOLUTION IN THE PINUS MONTEZUMAE COMPLEX: A COALESCENT APPROACH TO HYBRIDIZATION

Evolution ◽  
2000 ◽  
Vol 54 (4) ◽  
pp. 1218 ◽  
Author(s):  
Jennifer A. Matos ◽  
Barbara A. Schaal
Keyword(s):  
Chloroplast Evolution ◽  
Pinus Montezumae ◽  
Coalescent Approach

Evaluación de la supervivencia en sitios reforestados como indicador de la restauración del paisaje en el Área de Protección de Flora y Fauna Nevado de Toluca

2019 ◽  
pp. 97-117
Author(s):  
Erika Rocío Reyes González ◽  
Gustavo Enrique Hernández Jardines ◽  
Atzin Elihu Calvillo Arriola
Keyword(s):  
San Jose ◽  
Pinus Montezumae ◽  
Pinus Hartwegii ◽  
Cerro Prieto ◽  
Sociedad Civil ◽  
Nevado De Toluca

Gran parte de los ecosistemas forestales del planeta han sufrido degradación principalmente por prácticas relacionadas con el cambio de uso de suelo para fines agropecuarios, incluida la tala ilegal. El Área de Protección de Flora y Fauna Nevado de Toluca no queda exenta de los efectos de la deforestación y la degradación del bosque templado. Instituciones de gobierno, academia y sociedad civil han emprendido acciones de restauración y recuperación en favor de esta área protegida. El objetivo de este trabajo es presentar los resultados de la evaluación de la supervivencia de 144 plantaciones realizadas por Reforestamos México, asociación civil sin fines lucrativos, durante los años 2011 a 2015. El índice de supervivencia propuesto por la Comisión Nacional Forestal (Conafor) para evaluar el éxito de las plantaciones estima la cantidad de árboles vivos y muertos para obtener el porcentaje de supervivencia de cada predio con base en el número de árboles plantados para las plantaciones de los años 2014 y 2015. Además, se midió el vigor de los árboles y se determinó la especie que presentó la mejor respuesta de crecimiento y desarrollo únicamente para las plantaciones de los años 2014 y 2015. Las mayores supervivencias se localizaron en los parajes Latas Viejas (82%), Cerro Prieto (79%) y San José de las Huertas (79%), municipio de Zinacantepec, Estado de México, mientras que la menor supervivencia (36%) fue localizada en el paraje Cerro Gordo, en el mismo municipio. Pinus montezumae fue la especie que logró la mayor supervivencia (73%), mientras que Pinus hartwegii obtuvo la menor (70%). Esto último puede estar asociado a las pendientes pronunciadas, los suelos compactados por anteriores usos de suelos, el crecimiento de herbáceas por un mal mantenimiento y la presencia de ganado, factores que limitaron la supervivencia de las plantas.

scholarly journals Chloroplast genomes in Populus (Salicaceae): comparisons from an intensively sampled genus reveal dynamic patterns of evolution

2021 ◽  
Vol 11 (1) ◽  
Author(s):  
Jiawei Zhou ◽  
Shuo Zhang ◽  
Jie Wang ◽  
Hongmei Shen ◽  
Bin Ai ◽  
...  
Keyword(s):  
Phylogenetic Analyses ◽  
Population Level ◽  
Gene Content ◽  
Sequencing Data ◽  
Cellular Functions ◽  
Chloroplast Evolution ◽  
Chloroplast Genomes ◽  
Genome Features ◽  
Genome Annotations ◽  
Genome Analyses

AbstractThe chloroplast is one of two organelles containing a separate genome that codes for essential and distinct cellular functions such as photosynthesis. Given the importance of chloroplasts in plant metabolism, the genomic architecture and gene content have been strongly conserved through long periods of time and as such are useful molecular tools for evolutionary inferences. At present, complete chloroplast genomes from over 4000 species have been deposited into publicly accessible databases. Despite the large number of complete chloroplast genomes, comprehensive analyses regarding genome architecture and gene content have not been conducted for many lineages with complete species sampling. In this study, we employed the genus Populus to assess how more comprehensively sampled chloroplast genome analyses can be used in understanding chloroplast evolution in a broadly studied lineage of angiosperms. We conducted comparative analyses across Populus in order to elucidate variation in key genome features such as genome size, gene number, gene content, repeat type and number, SSR (Simple Sequence Repeat) abundance, and boundary positioning between the four main units of the genome. We found that some genome annotations were variable across the genus owing in part from errors in assembly or data checking and from this provided corrected annotations. We also employed complete chloroplast genomes for phylogenetic analyses including the dating of divergence times throughout the genus. Lastly, we utilized re-sequencing data to describe the variations of pan-chloroplast genomes at the population level for P. euphratica. The analyses used in this paper provide a blueprint for the types of analyses that can be conducted with publicly available chloroplast genomes as well as methods for building upon existing datasets to improve evolutionary inference.

scholarly journals The coalescent process in models with selection, recombination and geographic subdivision

1991 ◽  
Vol 57 (1) ◽  
pp. 83-91 ◽  
Author(s):  
Norman Kaplan ◽  
Richard R. Hudson ◽  
Masaru Iizuka
Keyword(s):  
Genetic Variation ◽  
Population Genetic ◽  
Genetic Model ◽  
Sequence Data ◽  
Balancing Selection ◽  
Similar Model ◽  
Proposed Model ◽  
Coalescent Approach ◽  
Neutral Mutations ◽  
Better Than

SummaryA population genetic model with a single locus at which balancing selection acts and many linked loci at which neutral mutations can occur is analysed using the coalescent approach. The model incorporates geographic subdivision with migration, as well as mutation, recombination, and genetic drift of neutral variation. It is found that geographic subdivision can affect genetic variation even with high rates of migration, providing that selection is strong enough to maintain different allele frequencies at the selected locus. Published sequence data from the alcohol dehydrogenase locus of Drosophila melanogaster are found to fit the proposed model slightly better than a similar model without subdivision.

scholarly journals Efecto de la exclusión de un área natural protegida en la composición y estructura arbórea

2018 ◽  
Vol 9 (5) ◽  
pp. 981-992
Author(s):  
Enrique Buendía-Rodríguez ◽  
Eduardo Alanís-Rodríguez ◽  
Oscar A. Aguirre-Calderón ◽  
Eduardo J. Treviño-Garza ◽  
Eulogio Flores-Ayala ◽  
...  
Keyword(s):  
Pinus Montezumae ◽  
Pinus Hartwegii ◽  
Abies Religiosa

El Parque Nacional Izta-Popo es un área natural protegida (ANP) que fue creada con la finalidad de mantener la representatividad de los ecosistemas. Actualmente, no se sabe la situación de zonas que fueron excluidas de aprovechamiento forestal. El objetivo fue evaluar el efecto de la exclusión de un ANP en la composición y estructura del arbolado por medio de caracterización dasométrica de un bosque templado en la región central de México. Se seleccionaron tres sitios cuadrados de 100 x 100 m (1 ha): dos dentro del ANP (Pinus hartwegii “BPiHa” y Pinus montezumae “BPiMo”) y un bajo aprovechamiento forestal (Abies religiosa “BAbRe”), donde se midió el diámetro normal (d1.30), altura total (h), para calcular el área basal (G), volumen total (vt), diámetro promedio (d), altura promedio (h), índice de esbeltez (h/d), densidad (dn). El BPiMo tiene una densidad de 149 individuos, área basal (39.21 m2 ha-1), volumen total (941.82 m3 ha-1), diámetros promedios (55.34 cm) y altura promedio (34.15 m). El BPiHa tiene una densidad de 133 individuos, área basal (23.27 m2 ha-1), volumen total (328.47 m3 ha-1), altura promedio (21.44 m) y diámetros promedios (43.83 cm). La BAbRe, tiene una alta densidad de 315 individuos, área basal (32.37 m2 ha-1), volumen total (468.58 m3 ha-1), diámetros promedios (31.71 cm) y altura promedio (24.22 m). Los bosques dentro de las ANP (BPiMo y BPiHa) requieren de aprovechamiento maderable, con la finalidad de regenerar la masa forestal. El BAbRe se encuentra bajo manejo forestal y cumple con esa condición.

Probabilistic Analysis Indicates Discordant Gene Trees in Chloroplast Evolution

2003 ◽  
Vol 56 (3) ◽  
pp. 330-340 ◽  
Author(s):  
Claus Vogl ◽  
Jonathan Badger ◽  
Paul Kearney ◽  
Ming Li ◽  
Michael Clegg ◽  
...  
Keyword(s):  
Probabilistic Analysis ◽  
Gene Trees ◽  
Chloroplast Evolution

Endophragmiella pinicola. [Descriptions of Fungi and Bacteria].

2007 ◽  
Author(s):  
D. W. Minter
Keyword(s):  
Czech Republic ◽  
New Zealand ◽  
Conservation Status ◽  
Myriophyllum Spicatum ◽  
Abies Alba ◽  
Picea Sitchensis ◽  
Taxus Cuspidata ◽  
Cedrus Deodara ◽  
Pinus Montezumae ◽  
Campbell Island

Abstract A description is provided for Endophragmiella pinicola, which colonies are found on dead decaying leaves, twigs and cones of conifers, occasionally on other substrata, very often in association with other fungi, effuse, greyish-brown. Information is included on geographical distribution (USA (Alabama, Kentucky and Tennessee), Campbell Island, India (Himachal Pradesh), New Zealand, Czech Republic, France, UK and Ireland), hosts (Abies alba, Cedrus deodara, Myriophyllum spicatum, Picea sitchensis, Picea sp., Pinus montezumae, P. nigra, P. radiata, P. sylvestris, P. thunbergii, P. torreyana, Pinus sp. and Taxus cuspidata), biology and conservation status.

Activated Carbon by Potassium Carbonate Activation from Pine Sawdust ( Pinus montezumae Lamb.)

2020 ◽  
Vol 43 (9) ◽  
pp. 1716-1725
Author(s):  
Francisco Márquez-Montesino ◽  
Neil Torres-Figueredo ◽  
Adela Lemus-Santana ◽  
Fernando Trejo
Keyword(s):  
Activated Carbon ◽  
Potassium Carbonate ◽  
Pine Sawdust ◽  
Pinus Montezumae

scholarly journals The Molecular Phylogeny of the New Zealand Endemic Genus Hadramphus and the Revival of the Genus Karocolens

Diversity ◽  
2018 ◽  
Vol 10 (3) ◽  
pp. 88
Author(s):  
Emily Fountain ◽  
Robert Cruickshank ◽  
Adrian Paterson
Keyword(s):  
New Zealand ◽  
Gene Sequence ◽  
Mitochondrial Gene ◽  
Single Gene ◽  
Morphological Characteristics ◽  
Nuclear Gene ◽  
Similar Species ◽  
Morphological Similarity ◽  
Coalescent Approach ◽  
Systematic Relationships

The delineation of species is important to the fields of evolution, ecology and conservation. The use of only a single line of evidence, e.g., morphology or a single gene sequence, may underestimate or overestimate the level of diversity within a taxon. This problem often occurs when organisms are morphologically similar but genetically different, i.e., for cryptic species. The Hadramphus genus contains four endangered, morphologically similar species of weevils, each endemic to a specific New Zealand region (Hadramphus spinipennis Chatham Islands, H. stilbocarpae Fiordland, H. tuberculatus McKenzie Country, H. pittospori Poor Knights Islands). The systematic relationships among these species are unclear. We used samples from these species and a closely related genus, Lyperobius huttoni, to obtain data from the mitochondrial gene cytochrome c oxidase subunit I and the nuclear gene internal transcribe spacer 2. In addition to the multi-locus coalescent approach, we modelled morphological characteristics combined with the genetic data. We found that H. spinipennis, H. tuberculatus and H. stilbocarpae were a closely related clade. Despite a strong morphological similarity, Hadramphus pittospori was found to be genetically distinct from the other Hadramphus species, which supports the resurrection of the monotypic genus Karocolens for this species.

Sign in / Sign up

Export Citation Format

Share Document